Nature子刊:叶海峰团队推出微型可控CRISPR激活平台HEAL,实现体内强力可控基因激活

  • 2026-01-13 15:27
  • 来源:100医药网
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CRISPR/Cas系统因其高度的易用性与多功能性,已成为基因组工程领域的革命性工具。催化失活型Cas变体(dCas)进一步拓宽了该系统在基础遗传学和转化医学中的应用潜力,同时避免了DNA断裂所引发的基因组不稳定性风险。其中,基于CRISPR-dCas的转录激活系统(CRISPRa)正被广泛应用于疾病模型的构建和潜在的基因治疗策略开发中,是推动分子生物学和精准医学发展的重要工具。

然而,当前主流的CRISPRa系统多基于dCas9或dCas12a,编码序列较长(约4-5.5 kb),限制了其在腺相关病毒(AAV)等体内递送载体中的应用,也难以满足复杂组织环境中对基因进行精准、可控调节的需求。虽有研究探索基于微型Cas12f的CRISPRa系统,但其激活效率与调控能力仍有较大局限,尚处于早期开发阶段。

针对这一挑战,2026年1月8日,华东师范大学生命科学学院、上海市调控生物学重点实验室、医学合成生物学研究中心叶海峰团队(管宁子副研究员为论文共同通讯作者,博士研究生万航、博士后孔德强和博士研究生严涛为论文共同第一作者)在Nature Communications期刊发表了题为:A compact and inducibledCas12f-based CRISPRa platform for programmablein vivogene activation的研究论文。

该研究成功构建了一种体积更小、激活能力更强、且调控方式灵活的基于dCas12f 的转录激活平台——HEAL。该平台兼容AAV递送,具备高达十万倍级别的内源基因转录激活能力,并结合红光与小分子诱导开关,在小鼠体内实现了对疾病关键基因的可控式激活,为小型化、高效能的CRISPRa系统的开发提供了全新范式。

HEAL系统的设计灵感源自微型基因编辑工具Cas12f-ge4.1,该系统基于超紧凑的Un1Cas12f1蛋白,适用于AAV介导的体内应用。

HEAL系统的设计及其治疗应用

在此基础上,研究团队首先对sgRNA骨架进行了结构优化,嵌入噬菌体来源的MS2茎环结构,以高效招募与RNA结合蛋白(MCP)融合的转录激活因子(p65-HSF1)。随后,通过对dCas12f蛋白进行工程化改造,增强其DNA结合能力与核定位效率,大幅提升了系统的转录激活强度。

最终构建的HEAL系统在哺乳动物细胞中展现出超越传统dCas9/dCas12a系统的强大激活性能,可实现超十万倍的内源基因激活,并可通过单个AAV载体完成递送。

为进一步实现精准时空调控,团队基于前期开发的红光诱导REDLIP系统构建了光控HEAL系统(OptoHEAL)。该系统通过红光调控RNA结合蛋白与转录激活因子的二聚化,在哺乳动物细胞和小鼠肝脏中实现了对目标基因的光照依赖性高效激活。

为拓展应用场景、摆脱外部设备依赖,研究团队还开发了小分子诱导的HEAL系统(ChemHEAL)。通过将RNA结合蛋白和转录激活因子分别与小分子诱导的二聚化蛋白融合,成功构建了四种可由临床安全小分子调控的转录激活系统。

单AAV递送HEAL系统缓解急性肾损伤小鼠症状

为验证其治疗潜力,研究团队利用单个AAV,将靶向Il10基因的HEAL系统递送到急性肾损伤小鼠肝脏,成功激活内源Il10的表达后,显著缓解了小鼠的肾损伤症状。

ChemHEAL系统对肥胖小鼠体重的控制效果

此外,将靶向Tslp基因的ChemHEAL系统递送到肥胖小鼠肝脏中,研究实现了通过小分子药物控制Tslp表达,从而有效降低了肥胖小鼠的体重。

综上所述,该研究开发的HEAL平台作为一种微型、高效、可控的CRISPRa系统,克服了传统CRISPRa载体尺寸大、难以通过单载体AAV递送的关键限制,实现了对内源基因的高效体内激活,并可通过红光/小分子双开关进行精确调控。该平台在基因功能研究、疾病模型构建及未来精准基因治疗中展现出重要潜力,为发展下一代可控式基因治疗策略提供了有力的技术支撑。

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41467-025-68183-5


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